차세대염기서열분석 기반 유전자 패널검사-비유전성 유전자검사-고형암-Level I
Next Generation Sequencing (NGS) Technology base Genetic Panel Test-Genetic
Tests for Somatic Variants-Solid malignant tumor-Level I
통합코드CB003병리과
보험분류나598-1나(1)(가)
유형검체
패밀리사람유전자분자유전검사
관리진료과병리과
작업과병리과
관련과진단검사의학과
시술시간(현행유지)
업무량(현행유지)
적응증
1. 고형암 환자의 조직에서 많은 수의 유전자 변이를 한 번에 확인하고 검출하는 검사임.
2. 유전자나 단백질의 발현량 또는 유전자의 돌연변이 등을 바탕으로 환자의 치료 방법을 선택하는개인 맞춤 의료기술이 발달에 따라 차세대염기서열분석법(Next GenerationSequencing, ‘이하 NGS’)은 환자의 암조직에서 나타날 수 있는 여러가지 비유전성 유전자 변이를 빠른 시간안에 진단하여 개인 맞춤 의료를 실현하는 데 효과적인 검사법임.
3. 대상 검출 유전자의 수가 2-30개 또는 대상 염기서열의 크기가 150kb 이하일 경우에해당.
실시방법
시술 전1. 병리진단지와 의뢰서를 확인 후 접수
2. 환자의 의무기록 및 영상소견 확인 후 환자 정보 입력
시술 중1. 병리의사가 검체의 슬라이드를 확인하여 가장 적절한 블록을 선택하고 종양의 세포밀도를 측정하여 검사에 적당한 조직인지 확인하며 필요한 경우 종양의 위치를 마커로 슬라이드에 표기
2. 선택된 블록에서 적절한 분량의 종양조직을 획득
3. 조직 절편에서 DNA를 추출
4. 추출한 DNA를 단편화하고 생성된 DNA 조각을 탐침자에 결합하고 증폭하여 라이브러리 조제
5. NGS 분석장비를 이용하여 염기서열 분석
6. NGS의 검사로부터 얻은 원데이터를 분석 소프트웨어를 이용하여 분석하여 결과의 품질을 평가하고 염기서열 정보 추출, 표준 염기서열에 맵핑한 해석결과 및 변이정보의 검출을 수행
7. 검출된 유전자 변이 정보를 바탕으로 환자의 임상양상과 각종 데이터베이스와의 대조와 데이터베이스 내 검색을 통해 최종 결과보고서 작성
시술 후1. 결과 전사와 확인
2. 정도관리 및 검사실 관리
전형적 사례
66세 / 여성 / 폐의 샘암종 / 장소: 병리과
1. 임상적 상황: 3달 전부터 발생한 마른기침과 1주일 전부터 발생한 호흡곤란을 주소로내원하였다. 흉부전산화 단층촬영검사에서 기관 옆 림프절 종대를 동반한 6cm 크기의우하엽 종괴와 소량의 우측 흉수가 관찰되었다. 우하엽 종괴에 대한 조직학적 검사에서샘암종으로 진단되었고 EGFR 유전자의 돌연변이 분석검사에서 L858R 돌연변이가 발견되어 상피세포 성장인자 수용체 티로신 키나제 저해제(epidermal growth factorreceptor tyrosin kinase inhibitor, ‘이하 EGFR TKI’)인 제피티닙(gefitinib, Iressa®, 이레사®)을 사용하여 대사활성과 종양크기의 현격한 감소를 보였다. 재발 없이 약제반응이 10개월 정도 유지되던 중 양전자단층촬영에서 기존에 있던 우하엽 종괴의 크기 및 FDG 섭취증가 소견과 함께 새로운 전이성 병변이 폐의 좌상엽에서 발견되었다. 전이 병소에 대한 조직검사를 시행하였다. 폐병변에서는 처음과 동일하게 샘암종으로 진단되었다. 이에환자의 전이 조직에 대해 NGS 검사가 의뢰되었다.
2. 대상 검체: 기관지 내시경을 통한 조직검사 검체
3. 차세대염기서열분석 기반 유전자 패널검사 결과: 기존의 EGFR 유전자에 L858R 돌연변이와 함께 T790M 돌연변이도 함께 발견되어 gefitinib에 저항성을 보이는 것으로 예상된다. 이에 3세대 EGFR TKI인 오시머티닙(osimertinib)을 사용할 수 있다. 그 외 암유전자인 TP53 유전자의 H179R 돌연변이도 함께 발견되었다.